1

A

L

Y

E

D

P

D

H

K

T

S

P

S

G

K

P

A

T

L

K

I

C

S

W

N

V

D

G

L

R

A

W

I

K

G

L

D

W

V

K

E

A

P

D

I

L

50

51

C

L

Q

E

T

K

C

S

E

N

K

L

P

A

E

L

Q

E

L

P

G

L

S

H

Q

Y

W

S

A

P

S

D

K

E

G

Y

S

G

V

G

L

S

R

Q

C

P

L

K

V

100

101

S

Y

G

I

G

D

E

H

D

Q

E

G

R

V

I

V

A

E

F

D

S

F

V

L

V

T

A

Y

V

P

N

A

G

R

G

L

V

R

L

E

Y

R

Q

R

W

D

E

A

F

150

151

R

K

F

L

K

G

L

A

S

R

K

P

L

V

L

C

G

D

L

N

V

A

H

E

I

D

L

R

N

P

K

G

N

K

N

A

G

F

T

P

Q

E

R

Q

G

F

G

E

200

201

L

Q

A

V

P

L

A

D

S

F

R

H

L

Y

P

N

T

P

Y

A

Y

T

F

W

T

Y

M

N

A

R

S

K

N

V

G

W

R

L

D

Y

F

L

S

H

S

L

250

251

P

A

L

C

D

S

K

I

R

S

K

A

L

G

S

D

H

C

P

I

T

L

Y

L

A

L

Motifs (only significant positions shown):

W N . . G . R
Simil
D1
D2
D3
D4
D5
Tot E
E1
E2
E3
E4
E5

D . . C . Q E . K
Simil
D1
D2
D3
D4
D5
Tot E
E1
E2
E3
E4
E5

G Y . G V
Simil
D1
D2
D3
D4
D5
Tot E
E1
E2
E3
E4
E5

D . E G R . I
Simil
D1
D2
D3
D4
D5
Tot E
E1
E2
E3
E4
E5

F . L . T . Y V P N A
Simil
D1
D2
D3
D4
D5
Tot E
E1
E2
E3
E4
E5

R L . Y R . . W
Simil
D1
D2
D3
D4
D5
Tot E
E1
E2
E3
E4
E5

C G D . N V . H
Simil
D1
D2
D3
D4
D5
Tot E
E1
E2
E3
E4
E5

G F . P Q E R
Simil
D1
D2
D3
D4
D5
Tot E
E1
E2
E3
E4
E5

V . L . D S F R . . Y P
Simil
D1
D2
D3
D4
D5
Tot E
E1
E2
E3
E4
E5

Y . F W . Y
Simil
D1
D2
D3
D4
D5
Tot E
E1
E2
E3
E4
E5

G . R . D Y
Simil
D1
D2
D3
D4
D5
Tot E
E1
E2
E3
E4
E5

S D H C P
Simil
D1
D2
D3
D4
D5
Tot E
E1
E2
E3
E4
E5

Detailed output:

Motifs

Reference

A

L

Y

E

D

P

D

H

K

T

S

P

S

G

K

P

A

T

L

K

I

C

S

W

N

V

D

G

L

R

A

W

I

K

G

L

D

W

V

K

E

A

P

D

I

L

50/106

Similarity

D1

D2

D3

D4

D5

Total E

E1

E2

E3

E4

E5

0.00

A

L

Y

E

D

P

D

H

K

T

S

P

S

G

K

P

A

T

L

K

I

C

S

W

N

V

D

G

L

R

A

W

I

K

G

L

D

W

V

K

E

A

P

D

I

L

0.10

L

K

I

C

S

W

N

V

D

G

L

R

A

W

I

K

D

W

V

K

E

A

P

D

I

L

0.20

L

K

I

C

S

W

N

V

D

G

L

R

A

P

D

I

L

0.30

L

K

I

C

S

W

N

V

D

G

L

R

D

I

L

0.40

W

N

V

D

G

L

R

D

I

L

0.50

Motifs

*

Reference

C

L

Q

E

T

K

C

S

E

N

K

L

P

A

E

L

Q

E

L

P

G

L

S

H

Q

Y

W

S

A

P

S

D

K

E

G

Y

S

G

V

G

L

S

R

Q

C

P

L

K

V

100/264

Similarity

D1

D2

D3

D4

D5

Total E

E1

E2

E3

E4

E5

0.00

C

L

Q

E

T

K

C

S

E

N

K

L

P

A

E

L

Q

E

L

P

G

L

S

H

Q

Y

W

S

A

P

S

D

K

E

G

Y

S

G

V

G

L

S

R

Q

C

P

L

K

V

0.10

C

L

Q

E

T

K

C

S

E

N

K

L

P

A

E

G

L

S

H

Q

Y

W

S

A

P

S

D

K

E

G

Y

S

G

V

G

L

S

R

Q

C

P

L

K

V

0.20

C

L

Q

E

T

K

C

E

G

Y

S

G

V

G

L

S

R

0.30

C

L

Q

E

T

K

G

Y

S

G

V

0.40

C

L

Q

E

T

K

0.50

Motifs

*

Reference

S

Y

G

I

G

D

E

H

D

Q

E

G

R

V

I

V

A

E

F

D

S

F

V

L

V

T

A

Y

V

P

N

A

G

R

G

L

V

R

L

E

Y

R

Q

R

W

D

E

A

F

150/366

Similarity

D1

D2

D3

D4

D5

Total E

E1

E2

E3

E4

E5

0.00

S

Y

G

I

G

D

E

H

D

Q

E

G

R

V

I

V

A

E

F

D

S

F

V

L

V

T

A

Y

V

P

N

A

G

R

G

L

V

R

L

E

Y

R

Q

R

W

D

E

A

F

0.10

S

Y

G

I

G

D

E

H

D

Q

E

G

R

V

I

V

A

E

F

D

S

F

V

L

V

T

A

Y

V

P

N

A

G

R

G

L

V

R

L

E

Y

R

Q

R

W

D

E

A

F

0.20

D

Q

E

G

R

V

I

F

V

L

V

T

A

Y

V

P

N

A

R

L

E

Y

R

Q

R

W

0.30

Motifs

*

Reference

R

K

F

L

K

G

L

A

S

R

K

P

L

V

L

C

G

D

L

N

V

A

H

E

I

D

L

R

N

P

K

G

N

K

N

A

G

F

T

P

Q

E

R

Q

G

F

G

E

200/464

Similarity

D1

D2

D3

D4

D5

Total E

E1

E2

E3

E4

E5

0.00

R

K

F

L

K

G

L

A

S

R

K

P

L

V

L

C

G

D

L

N

V

A

H

E

I

D

L

R

N

P

K

G

N

K

N

A

G

F

T

P

Q

E

R

Q

G

F

G

E

0.10

R

K

F

K

P

L

V

L

C

G

D

L

N

V

A

H

E

I

D

L

R

N

P

K

G

N

K

N

A

G

F

T

P

Q

E

R

Q

G

F

G

E

0.20

P

L

V

L

C

G

D

L

N

V

A

H

E

I

D

L

R

N

P

K

G

N

G

F

T

P

Q

E

R

0.30

C

G

D

L

N

V

A

H

0.40

Motifs

*

Reference

L

Q

A

V

P

L

A

D

S

F

R

H

L

Y

P

N

T

P

Y

A

Y

T

F

W

T

Y

M

N

A

R

S

K

N

V

G

W

R

L

D

Y

F

L

S

H

S

L

250/561

Similarity

D1

D2

D3

D4

D5

Total E

E1

E2

E3

E4

E5

0.00

L

Q

A

V

P

L

A

D

S

F

R

H

L

Y

P

N

T

P

Y

A

Y

T

F

W

T

Y

M

N

A

R

S

K

N

V

G

W

R

L

D

Y

F

L

S

H

S

L

0.10

L

Q

A

V

P

L

A

D

S

F

R

H

L

Y

P

N

T

P

Y

A

Y

T

F

W

T

Y

M

N

A

R

S

K

N

V

G

W

R

L

D

Y

F

L

S

H

S

L

0.20

V

P

L

A

D

S

F

R

H

L

Y

P

Y

T

F

W

T

Y

M

N

A

R

S

K

N

V

G

W

R

L

D

Y

F

L

S

H

S

L

0.30

Y

T

F

W

T

Y

G

W

R

L

D

Y

0.40

G

W

R

L

D

Y

0.50

Motifs

*

Reference

P

A

L

C

D

S

K

I

R

S

K

A

L

G

S

D

H

C

P

I

T

L

Y

L

A

L

276/593

Similarity

D1

D2

D3

D4

D5

Total E

E1

E2

E3

E4

E5

0.00

P

A

L

C

D

S

K

I

R

S

K

A

L

G

S

D

H

C

P

I

T

L

Y

L

A

L

0.10

P

A

L

C

D

S

K

I

G

S

D

H

C

P

I

T

L

Y

L

0.20

G

S

D

H

C

P

I

0.30

S

D

H

C

P

I

0.40

S

D

H

C

P

0.50

This calculation was based on the background probability distribution created for 5 bins from 141206021 residues:

A 8.136%, C 1.422%, D 5.408%, E 6.740%, F 3.882%, G 7.041%, H 2.285%, I 5.927%, K 5.884%, L 9.678%, M 2.411%, N 4.054%, P 4.780%, Q 3.959%, R 5.504%, S 6.674%, T 5.359%, V 6.823%, W 1.097%, Y 2.935%

Distribution of amino acids into bins:

E1 ...	F,I,L,M,V,W	C,Y	A,H	Q,R,T	D,E,G,K,N,P,S
E2 ...	E,H,K,Q,R,W	D,F,M,Y	A,C,I,L,N,T,V	P,S	G
E3 ...	A,E	L,M,V	D,G,H,I,K,Q,S,T	C,F,N,R	P,W,Y
E4 ...	I,K,L,P,R,V	A,F,G,S,T,Y	E,N,Q,W	D,H,M	C
E5 ...	C,R,T,V	I,Q,S,Y	H,K,M,N	A,D,F,G,L	E,P,W